La clorexidina è un agente antimicrobico ampiamente utilizzato in prodotti per la cura degli animali e può essere efficace contro batteri Gram-positivi e Gram-negativi.

Inoltre, Clorexyderm Shampoo è efficace contro la Malassezia pachidermatis fino a una diluizione con acqua in proporzione 1:1. La Malassezia pachidermatis è un lievito che può causare infezioni della pelle nei cani e nei gatti, quindi la capacità del prodotto di affrontare questa problematica è un punto positivo.